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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

上海首发革命文物保护利用白皮书******

　　中国共产党第一次全国代表大会会址。上海市文化和旅游局供图

　　中新网上海1月9日电 (王笈)近日，上海市文化和旅游局、上海市文物局正式发布国内首部不可移动革命文物白皮书——《上海市不可移动革命文物保护利用报告(2018-2022年)》(以下简称《报告》)，系统全面总结上海革命文物保护利用工作。

　　上海是中国共产党的诞生地、初心始发地，革命文物资源数量众多、内涵丰富，在中国革命历史上有着举足轻重的地位。

　　四行仓库抗战旧址。上海市文化和旅游局 供图

　　《报告》指出，上海不可移动革命文物(以下简称“革命文物”)主要呈现4个特点，即保护级别全、分布区域广、时间跨度长、建筑类型多。250处革命文物涉及全部4个保护等级，在上海各区均有分布，时间跨度长达150年，新民主主义革命时期的占82%，建筑类型涵盖里弄住宅、传统民居、联排住宅、花园别墅、公寓大楼、公共建筑等，呈现出革命活动的广泛性、深入性。

　　《报告》指出，在上海市委、市政府的领导下，上海革命文物保护基础不断夯实，展览展示水平和铸魂育人功能明显增强，革命文物传承弘扬和保护利用体系初步形成。

　　一是保护成效显著。5年来累计投入资金约5亿元，对62处(占比24.8%)革命文物进行了各类保护修缮，经评估保存基本完好以上有198处(占比80%)。

　　二是利用方式多样。有114处(占比46%)进行了各类活化利用，改建为革命类博物馆、纪念馆，增设主题展览，设立纪念碑、纪念雕塑，融入公共空间等。

　　三是开放参观便捷。有146处(占比58%)对外开放，具备较为成熟的展示功能，参观体验良好。

　　四是宣传讲解多元。225处(占比90%)开展各类线上宣传，配备专兼职讲解人员，充分体现了社会各界的积极性和主动性。

　　《报告》还总结了上海5年来革命文物保护利用和传承弘扬方面的具体做法和经验成效。包括：注重顶层设计，工作体系不断完善；加强整体保护，革命文物焕发新生；提升展示水平，讲好革命文物故事；深化系统研究，阐释革命文物内涵；强化教育功能，发挥铸魂育人作用；拓展运用方式，助力文旅融合发展；加强宣传推介，提升传播力影响力。

　　陈望道旧居。上海市文化和旅游局 供图

　　据悉，上海市文化和旅游局、上海市文物局将依据《报告》成果，对上海不可移动革命文物施行分级分类管理，提出具体工作建议，发挥好革命文物在党史学习教育、革命传统教育、爱国主义教育等方面的重要作用。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）